צינור הניקוז של דרכי המרה משמש יחד עם האנדוסקופ, וצינור ניקוז שוכן מוחדר דרך מעבר האף לניקוז מרה זמני. צינור הניקוז של צינור המרה מוחדר לצינור המרה דרך הפפילה התריסריון מתחת לאנדוסקופ, והקצה השני מובל החוצה מחלל הפה או מחלל האף דרך התריסריון, הקיבה, הוושט, הלוע וכו'. ניקוז מרה לאחר ניתוח אבנים אנדוסקופי של דרכי מרה וכריתת כיס מרה אנדוסקופית. זוהי שיטה פשוטה ויעילה להקלה על חסימה. אבחון וטיפול במחלות הדורשות ניקוז דרכי מרה.
